База данных применения химических эффектов
основана на ТРИЗ (теория решения изобретательских задач)

На главную страницу | О проекте | Контакты

Вы находитесь здесь: dace.ru / Новости химии / Новая методика анализа ДНК изучает геном неандертальцев

Архивы новостей:
2008 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2009 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2010 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2011 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2012 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2013 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2014 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2015 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2016 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2017 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2018 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2019 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2020 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2021 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2022 год: январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь

Новая методика анализа ДНК изучает геном неандертальцев

Новая, более простая и дешевая методика секвенирования ДНК была использована для расшифровки и анализа митохондриального генома пятерых неандертальцев.

Исследователи отмечают, что новая методика позволяет обойти трудности, возникающие при анализе частично разрушенной древней ДНК, что позволяет лучше понять генетические черты и особенность эволюции неандертальцев и других древних видов.

В прошлом году группа под руководством Сванте Паабо (Svante Pääbo) из Института Эволюционной Антропологии Макса Планка (Лейпциг) проделала первый полный анализ митохондриальной ДНК неандертальца с помощью секвенирования методом «выстрела из дробовика» (shotgun sequencing – метод определения первичной нуклеотидной последовательности с использованием крупных стохастических фрагментов с перекрывающимися последовательностями). Тем не менее, эта методика требует больших затрат времени, в ней расходуются большие количества драгоценной древней ДНК, при реализации этой методики происходит секвенирование всех нуклеиновых кислот образца, при этом 99% всех нуклеиновых кислот, извлекаемых их древних окаменелостей обычно принадлежит бактериям и грибкам, внедрившимся в костную ткань останков.

Для того чтобы избежать трудностей, описанных выше, Паабо с коллегами разработал ускоренный, дешевый и дающий меньшее количество отходов метод реконструирования геномов древних биологических видов – метод улавливания расширения праймера [primer extension capture (PEC)]. Еще одна причина заключалась и в том, что предоставленные для изучения новые образцы оказались в плохо сохранившемся состоянии, и их анализ методом «выстрела из дробовика» мог бы стоить миллионы долларов.

Исследователи смогли «оживить» драгоценные образцы древних ДНК (например, ДНК неандертальцев), получая многие тысячи копий ДНК из каждой исходной молекулы ДНК. Многократное повторение этого процесса позволяет получить библиотеки из последовательностей анализируемых ДНК. В методике используется 5'-биотинированные олигонуклеотидные праймеры и ДНК-полимераза, позволяющие отделить ДНК неандертальцев от загрязняющих образец молекул «посторонних» ДНК. Такой подход позволяет уменьшить время на анализ образца и понизить его стоимость в несколько тысяч раз.

Источник: Science, 2009, DOI: 10.1126/science.1174462

Источник: http://www.chemport.ru
22.07.2009 12:19




dace.ru © 2005-2022 гг.
Сделано dkos.ru