|
Вы находитесь здесь: dace.ru / Новости химии / Новый способ секвенирования РНК
Архивы новостей:
2008 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2009 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2010 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2011 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2012 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2013 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2014 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2015 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2016 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2017 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2018 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2019 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2020 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2021 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2022 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2023 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2024 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
Новый способ секвенирования РНК
Возможно, что исследователи из США смогли решить главную проблему современной молекулярной биологии: непосредственное секвенирование единичной молекулы РНК. В последнее время появляется многочисленная информация о роли РНК в клетке не только как участника процесса белкового синтеза, но и как регулятора генов или других процессов.
Флуоресцентно-меченные нуклеотиды связываются с закрепленной молекулой РНК до разрыва виртуального терминатора и добавления очередного комплементарного нуклеотида.
(Рисунок из Nature, 2009, DOI: 10.1038/08390)
Определение первичной последовательности расположения азотистых оснований в цепи РНК нельзя реализовать непосредственно: обычно для этого применяется процесс обратной транскрипции – получения на основании РНК комплементарного отрезка ДНК, после чего полученная ДНК подвергается амплификации и секвенируется. Множественные операции, необходимые для проведения такого определения приводят к появлению и накоплению ошибок.
Исследователи из биотехнической компании Helicos, расположенной в Массачусетсе, разработали способ непосредственного секвенирования РНК. Метод основан на закреплении одного из концов РНК с поверхностью и использовании цепи в качестве шаблона для получения комплементарной нити нуклеиновой кислоты с пошаговым вводом нуклеотида за нуклеотидом с одновременным считыванием структуры вводимого нуклеотида.
Реализовать такой процесс удается за счет использования модифицированных нуклеотидов, отличающихся двумя ключевыми особенностями: в них введена флуоресцентная метка, а также в них содержится «виртуальный терминатор» («virtual terminator»), группа препятствующая внедрению дополнительных нуклеотидов в растущую цепь. Связывание модифицированного нуклеотида с комплементарной парой в составе анализируемой РНК приводит к проявлению флуоресцентного сигнала. После регистрации такого сигнала раствор промывают, отщепляют защитную группу – «виртуальный терминатор» и вводят второй нуклеотид; такой процесс многократно повторяется до полного определения первичной последовательности исследуемой РНК. Для проверки работоспособности концепции исследователи из Helicos определили первичное строение нескольких десятков тысяч РНК с помощью новой методики.
Источник: Nature, 2009, DOI: 10.1038/08390
Источник: http://www.chemport.ru 25.09.2009 23:43 | |
|